许愿所需的忍者碎片数量根据忍者品质有明确要求，招募S级忍者需要100片碎片，A级和B级忍者需要40片，而C级忍者仅需10片。
玩家若想在组织中进行祈愿，必须先拥有该忍者一定数量的碎片作为前提，具体规则是S级忍者需要50片以上，A级和B级忍者需要20片以上，C级忍者则需要5片以上，这意味着无法完全通过祈愿白嫖一个全新忍者。
除了常规的组织祈愿，游戏内的许愿宝库活动是获取S级忍者碎片的重要途径，该活动每四个月出现一次，根据概率测算，进行100次抽取大约可以获得35至40片S级忍者碎片。
玩家的VIP等级会直接影响祈愿系统的效率，等级越高，每次许愿后能获得的碎片数量上限就越多，同时每周可以捐赠给其他人的碎片次数也会增加，这有助于在组织内更高效地流转碎片。
通过组织祈愿捐赠碎片不仅能帮助队友，捐赠者自身每次也能获得经验奖励，并且当每周累计捐赠达到一定数量后，还可以领取额外的捐赠宝箱奖励，该系统在每周一晚上7点会重置次数并补充祈愿绘马。
许愿宝库活动设有保底机制，例如50次抽取必定能获得一组5片的S忍碎片，而要保底兑换出一个完整的S级忍者，通常需要准备约300次抽取，折算下来大约需要50400金币，实际消耗会因运气有所浮动。
