少年三国志中，叛军是魏、蜀、吴、群雄四大阵营共同的敌对势力，并非单一国家的专属对手，四大阵营玩家均需参与围剿叛军玩法获取核心资源。叛军以张角、董卓、于吉、吕布四大BOSS为核心，随机刷新于主线副本扫荡过程中，等级随玩家挑战次数逐步提升，不同叛军的阵型与机制存在差异，张角为1带5阵型，董卓仅后排3只，于吉是3带3，吕布则为6个吕布同阵，每类叛军的攻击模式与血量阈值不同，对阵容搭配与输出节奏要求也各有侧重。
围剿叛军玩法在角色等级达到35级时开启，是获取赵云、张辽等核心武将碎片、天命石、战功与元宝的关键途径，战功商店可兑换蜀魏核心武将碎片，天命石则用于武将天命系统养成。攻打叛军需消耗征讨令，该道具每小时自动恢复1个，上限为10个，也可在商城购买补充，每日13:00-13:30全力一击消耗征讨令减半，19:00-19:30攻打可获得功勋翻倍，这两个时段是集中挑战的黄金期，能最大化资源收益。叛军战斗有严格回合机制，前三回合叛军攻击伤害极低，第四回合会释放秒杀全员的大招，因此需在前三回合打出极限伤害，布阵时1号位放增益辅助武将，2号位安排高爆发输出，其余位置优先选择攻击一排或随机打3个目标的武将，避免全体攻击技能浪费输出。
四大阵营应对叛军有不同的阵容搭配思路，蜀国凭借关羽无限超合击的优势，是叛军输出的强势阵营，核心阵容围绕刘关张构建，搭配回怒武将保证技能循环；魏国以张辽、司马懿为核心，配合控制与增伤武将，稳定打出持续伤害；群雄依靠吕布、于吉的高爆发与闪避特性，追求短时间内的极限输出；吴国则以双周瑜为核心，搭配大小乔提供光环与续航，虽整体输出略弱，但可通过合理布阵弥补差距。武将突破等级、装备精炼、宝物强化与天命系统是提升叛军伤害的关键，资源需集中投入核心输出武将，红色武器精炼至45级、天命等级高出辅助3-4级，能显著提升战斗表现，同时可选择消耗2个征讨令激活2.5倍攻击加成，快速压低叛军血量。
挑战叛军时，触发叛军的玩家可分享给好友共同攻打，好友参与也能获得奖励，叛军存在逃跑倒计时，需在时限内完成击杀，否则会损失部分奖励。每次攻打可获得功勋，累计功勋达到指定数值可领取银两、经验金龙等奖励，每日功勋排行榜前200名玩家还能获得战功，战功可在战功商店兑换稀有道具，成功击杀叛军后，触发者与最后一击玩家可领取额外元宝奖励。自动围剿功能可简化操作，在征战界面的围剿叛军入口设置自动击杀方案，即可高效完成日常挑战，稳定获取养成资源，助力阵营战力快速提升。
